Thèses soutenues

Alicia Jacques, Soutenance le 20 décembre 2023
Introduction de diversité génétique dans les populations animales à partir de collections cryoconservées"
Direction : Michèle Tixier-Boichard et Gwendal Restoux 

Carla Gouin, Soutenance le 20 décembre 2023
Tropisme cellulaire initial du SARS-CoV-2 dans le poumon humain : du poumon entier aux sous-populations de macrophages
Direction : Isabelle Schwartz 

Mélissa Bessonne, Soutenance le 12 décembre 2023
Développement et caractérisation fonctionnelle de nanoligands ciblant l’ARN-polymérase des virus Influenza 
Direction : Bernard Delmas

Lena Kleij Cortés, Soutenance 11 décembre 2023
Identification et validation des déterminants de virulence chez les virus équins circulants 
Direction : Bernard Delmas

Henri Lagarde, Soutenance le 30 novembre 2023
Mieux comprendre les composantes des résistances à l’hyperthermie et à l’hypoxie aiguës chez la truite arc-en-ciel, à des fins de sélection
Direction : Mathilde Dupont-Nivet et Delphine Lallias

​Laure-Hélène Maugan : Soutenance le 27 juin 2023
Développement et intérêt d’une évaluation génétique et génomique combinée en bovins laitiers
Direction de thèse : Vincent Ducrocq

Elitsa Ivanova : Soutenance le 14 mars 2023
La glande mammaire : Rôle de SOCS2 dans son développement et impact d’une inflammation lors de lactations successives"
Direction Fabienne Le Provost

Katy Paul : Soutenance le 22 décembre 2022
Évolution de la diversité génétique dans des populations domestiquées de truites arc-en-ciel 
Direction : Florence Phocas (GABI).

Yueying ZHU : Soutenance le 12 décembre 2022
Identification et caractérisation de déterminants moléculaires de virulence impliqués dans l’acquisition du fer chez Flavobacterium psychrophilum
Direction : Tatiana Rochat et d'Eric Duchaud (VIM).

Antoine Leduc : Soutenance le 9 décembre 2022
Recherche, chez la vache laitière, de biomarqueurs du déficit énergétique dans le lait
Direction : M. Boutinaud (UMR PEGASE) et F. Le Provost (GABI – GALAC) 

Romina VIA Y RADA : soutenance le 6 décembre 2022
Environnement métabolique et programmation épigénétique de l’embryon pré-implantatoire chez le lapin 
Direction : Sophie Calderari et Véronique Duranthon (BREED)

Fanny Mollandin : Soutenance le 28 septembre 2022
Intégration d’annotations fonctionnelles dans des modèles de prédiction génomique bayésiens »
Direction : Andrea RAU (GABI – GIBBS) et Pascal Croiseau (GABI – G2B).

Mélanie Pailles : Soutenance le 4 juillet 2022
L'hétérochromatine comme marqueur de l'état de pluripotence : comparaison de modèles in vivo (embryons de mammifères) et in vitro (cellules souches)
Direction : Amélie Bonnet-Garnier (BREED), Alice Jouneau (BREED) 

Valentin Coste, soutenance le 24 juin 2022
Identification de biomarqueurs de la qualité de la semence bovine, modélisation statistique et hypothèses biologiques
Direction : Florence Jaffrezic (GABI), Hélène Kiefer (BREED) et Laurent Schibler (ELIANCE)

Emilie Derisoud, soutenance le 28/03/22
Effets de l’âge, de la parité et de la lactation de la jument poulinière sur l’embryon, le placenta, la lactation et le développement du poulain."
Direction : Pascale Chavatte-Palmer (UMR BREED)

Jessica Morel, soutenance le 23/03/2022
L'ARN-polymérase des virus Influenza et ses intéractions avec la chromatine.
Direction : Bernard Delmas (unité VIM) et Christian Muchardt (CNRS)

Camille Migne soutenance le 25 février 2022
Le virus Kemerovo, un orbivirus encéphalitique transmis par les tiques : études in vivo et in vitro
Direction : Sara Moutailler et Houssam Attoui (unités Bipar/Virologie)

Hortense Decool, soutenance le 20/01/2022
Etude structurale et fonctionnelle du complexe polymérase du métapneumovirus humain (hMPV), cible pour le développement d'antiviraux.
Direction : Jean-François Elouët (Unité VIM)

Anaïs Cazals, Soutenance le 9 décembre 2021
Etude de l’impact de la génétique de l’hôte et de la composition du microbiote intestinal sur le portage de Salmonella Enteritidis chez la souris et la poule
Direction : Fanny Calenge (GABI) et Jean Jaubert

Anqui Wang, soutenance le 29 septembre 2021
Développement d'aptamères pour l'étude d'Anaplasma phagocytophilum
Direction : Grégory Karadjian et Isabelle Vallée, Unité Bipar

Djabir Larkem, soutenance le 30/06/2021
Génération d'un nouveau prion spontané et analyse biologique et structurale des fibres amyloïdes lui correspondant.
Direction : Michel Dron (Unité VIM) et Christina Sizun (CNRS)

Joëlle Mettier, soutenance le 29/06/21
de la protéine PB1-F2 des virus Influenza A dans l'adaptation d'une souche virale à son hôte.
Direction : Ronan Le Goffic et Christophe Chevalier (Unité VIM)

Ronan Griot, soutenance le 30/03/21 
Développement d'outils et de méthodes de sélection génomique pour le bar et la daurade.
Direction : Marc Vandeputte (GABI), François Allal et de Sophie Brard-fudulea.

Manon Chadourne soutenance le lundi 29 mars 2021
La suppression de Topaz1 perturbe la méiose et l'expression des ARN non-codant longs testiculaires au cours de la spermatogenèse murine.
Direction : Béatrice Madon-Pepin et Eric Pailhoux (UMR BREED)

Céline Bourdon soutenance le 15 mars 2021
Recherche d'associations entre microARNs, variants génétiques et QTL laitiers chez les bovins, caprins et ovins
Direction : Fabienne Le Provost (UMR GABI) et Gwenola Tosser-Klopp (UMR GenPhyse)

Eliaou Sellem soutenance le 15 mars 2021
Les petits ARN non codants du spermatozoïde bovin : de potentiels biomarqueurs de la fertilité mâle ?
Direction : Hélène JAMMES (UMR BREED) et Laurent SCHIBLER (Allice)

Manon Lemasson soutenance le 22 janvier 2021
Dialogue moléculaire des virus de l’encéphalite à tique et louping ill avec leur arthropode vecteur, la tique Ixodes ricinus
Direction : Dr. Jennifer Richardson et Dr. Sandrine Lacour (UMR Virologie du Laboratoire de Santé Animale)

Sylvain Lempereur (unité TEFOR) soutenance le 18 décembre 2020
Analyse morphométrique du cerveau de poisson zèbre: mise en place de procédures d'imagerie et de segmentations rapides
Direction : Hugues Tabot et Jean-Stephane Joly (unité TEFOR)

Jonathan d'Ambrosio (unité GABI) soutenance le 17 décembre 2020
L’intérêt et optimisation de la sélection génomique chez la truite arc-en-ciel
Direction : Florence Phocas et Mathilde Dupont-Nivet (GABI)

Lidia Chavinskaia (unité GABI) soutenance le 16 décembre 2020
La vache globale. La génétique quantitative dans la globalisation de la sélection bovine
Direction : Pierre-Benoit Joly et Vincent Ducrocq (GABI)

Anna-Charlotte Doublet (unité GABI) soutenance le 10 décembre 2020
La diversité génétique à l’ère de la génomique : évolution de la consanguinité et ses conséquences dans trois races bovines laitières françaises
Direction : Denis Laloë (GABI)

Gwendoline David (unité GABI) soutenance le 9 décemre 2020
Structuration spatio-temporelle des communautés microbiennes dans les écosystèmes d’eau douce
Direction : Elisa Thébault (Laboratoire Ecologie, Systematique et Evolution) et Gwendal Restoux (GABI)

Audrey Hulot (unité GABI) soutenance le 26 novembre 2020
Analyse de données -omiques : clustering et inférence de réseaux
Direction : Henri-Jean Garchon et Florence Jaffrézic (GABI)

Sébastien Taussat (unité GABI) soutenance le 26 juin 2020
Etude du déterminisme génétique de l’efficience alimentaire en bovins allaitants en vue d’une prise en compte dans les évaluations génomiques bovine
Direction : Gilles Renand (GABI) et Sébastien Fritz (Allice)

Clémentine Escoufflaire (unité GABI) soutenance le 16 juin 2020
Détection chez le bovin de polymorphismes génétiques au niveau du génome mitochondrial et des chromosomes sexuels et caractérisation de leurs effets sur les caractères de production, reproduction et santé
Direction : Hélène Hayes (GABI)

Francesca Massacci (unité GABI) soutenance le 17 mars 2020
Une approche intégrative pour l’étude de l’impact des antibiotiques sur le microbiote intestinal du porc et leurs alternatives pour la prévention des maladies liées à la production des porcs
Direction : Claire Rogel-Gaillard (GABI) et Paolo Trevisi

Marie Berodier (unité GABI) soutenance le 30 janvier 2020
Utilisation en ferme des données de génotypage pour une gestion optimisée et durable de l'élevage laitier
Direction : Vincent Ducrocq (GABI)