Séminaire projets H2020 AQUA-FANG, BovReg et GENE-SWitCH : résultats et perspectives actuelles

Les projets AQUA-FAANG, BovReg et GENE-SWitCH - tous les trois avec une forte participation d’INRAE - sont aujourd’hui les contributeurs majeurs de l’initiative internationale FAANG (Functional Annotation of Animal

Genomes ; http://www.faang.org/).

Les programmes de travail de ces projets ont de nombreux points communs. En particulier, ils sont centrés sur l’annotation fonctionnelle des génomes de plusieurs espèces (poissons, bovins, poulets et porcs) et sur l’utilisation des nouvelles annotations pour répondre à des questions biologiques ciblés.

Les scientifiques de GABI illustreront l’état d’avancement des activités qu’ils conduisent dans ces deux contextes.

La création de EuroFAANG initié par ces trois projets permet un changement d'échelle et de perspective au niveau européen qui concerne aussi les nouveaux projets internationaux auxquels INRAE participe depuis récemment.

Ces sujets et perspectives seront discutés ensemble dans une table ronde finale.

Programme prévisionnel :

• 9H00-9H05 Connections et Bienvenue
• 9H05-9H15 Elisabetta Giuffra (GeMS) Les trois projets H2020 dans la vision "FAANG to Fork"
• 9H15-9H40 Hervé Acloque (GaLac) Annotation des génomes du porc et de la poule: collections d'échantillons et données -omiques (GENE-SWitCH)
• 9H40-10H05 Delphine Lallias (GenAqua) et Pierre Boudinot (VIM) Vers la compréhension des mécanismes moléculaires associés à la résistance aux maladies chez la truite arc-en-ciel (AQUA-FAANG)
• 10H05-10H30 Smahane Chalabi (GeMS) Influence du régime alimentaire et de l'épigénétique chez le porc : analyse des données d'accessibilité de la chromatine (GENE-SWitCH)
• 10H30-11H00 Pause café 20 min
• 11H00-11H25 Marie-Pierrre Sanchez (G2B) Méta-analyses GWAS à partir des séquences complètes du génome (BovReg)
• 11H25-12H00 Andréa Rau (GiBBS) et
• Pascal Croiseau (G2B) Intégration d’annotations biologiques complexes dans les modèles bayésiens de prédiction génomique : Evaluation et extension du modèle BayesRC (GENE-SWitCH & BovReg)
• 12H00-12H30 Table ronde animée par les orateurs et avec la participation de Frédérique Pitel et Tatiana Zerjal (H2020 GERONIMO) et Eric Pailhoux (H2020 RUMIGEN)